Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAP1GDS1P52306 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms