Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR1P51861 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR1P51861 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR1P51861 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR1P51861 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR1P51861 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR1P51861 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR1P51861 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR1P51861 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR1P51861 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR1P51861 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms