Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DAP3P51398 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DAP3P51398 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DAP3P51398 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DAP3P51398 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DAP3P51398 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DAP3P51398 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DAP3P51398 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms