Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRB1P49407 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARRB1P49407 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms