Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms