Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT5P48643 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT5P48643 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT5P48643 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT5P48643 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT5P48643 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT5P48643 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT5P48643 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT5P48643 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms