Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABIFP47224 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABIFP47224 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABIFP47224 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABIFP47224 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABIFP47224 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABIFP47224 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABIFP47224 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABIFP47224 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABIFP47224 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABIFP47224 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms