Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RANGAP1P46060 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RANGAP1P46060 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RANGAP1P46060 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms