Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV4P43268 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV4P43268 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV4P43268 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ETV4P43268 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ETV4P43268 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV4P43268 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV4P43268 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV4P43268 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV4P43268 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms