Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL5P42830 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL5P42830 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL5P42830 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL5P42830 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL5P42830 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CXCL5P42830 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL5P42830 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL5P42830 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL5P42830 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL5P42830 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms