Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP2P42575 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP2P42575 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP2P42575 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP2P42575 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP2P42575 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP2P42575 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP2P42575 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP2P42575 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP2P42575 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP2P42575 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP2P42575 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms