Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCIP41743 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCIP41743 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms