Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4AP40617 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4AP40617 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms