Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6V1E1P36543 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 529.1 ms