Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	SPS18	YNL204C	903 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	SLD7	YOR060C	774 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YBR139W	YBR139W	1527 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	PRE9	YGR135W	777 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YHR214W	YHR214W	612 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YAR066W	YAR066W	612 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	ADD37	YMR184W	597 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	CUZ1	YNL155W	825 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	CDC48	YDL126C	2508 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	ATG18	YFR021W	1503 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YIL001W	YIL001W	1542 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	TRS85	YDR108W	2097 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YLR283W	YLR283W	945 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	FEX1	YOR390W	1128 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YPL077C	YPL077C	723 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	FEX2	YPL279C	1128 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YCL022C	YCL022C	516 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YND1	YER005W	1893 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NOP58	YOR310C	1536 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	DCV1	YFR012W	609 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YMR315W	YMR315W	1050 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	MET3	YJR010W	1536 nt		3.84	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.84	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	THI7	YLR237W	1797 nt		3.84	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	PRM1	YNL279W	1986 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RTC1	YOL138C	4026 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	LAS21	YJL062W	2493 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	CIN5	YOR028C	888 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SRB6	YBR253W	366 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SSH1	YBR283C	1473 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	TDA11	YHR159W	1515 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	JHD2	YJR119C	2187 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RAD1	YPL022W	3303 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	NUG1	YER006W	1563 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	YLR407W	YLR407W	687 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SUI1	YNL244C	327 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	TPA1	YER049W	1935 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	PEX7	YDR142C	1128 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	DBR1	YKL149C	1218 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	YGP1	YNL160W	1065 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	STE12	YHR084W	2067 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	BBC1	YJL020C	3474 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	DPB2	YPR175W	2070 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	APM4	YOL062C	1476 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SLD2	YKL108W	1362 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	HSP31	YDR533C	714 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	YMR082C	YMR082C	357 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SCP1	YOR367W	603 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	NCE102	YPR149W	522 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	PWR1	PWR1	941 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	ADP1	YCR011C	3150 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RFU1	YLR073C	603 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	ROT1	YMR200W	771 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SIW14	YNL032W	846 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	DCS2	YOR173W	1062 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	VID28	YIL017C	2766 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	SSO1	YPL232W	873 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	UBP7	YIL156W	3216 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SHE2	P36068	ECM32	YER176W	3366 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	RPL8A	YHL033C	771 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	CIA2	YHR122W	696 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	ORM2	YLR350W	651 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	ATG17	YLR423C	1254 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	SWP1	YMR149W	861 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	UBA3	YPR066W	900 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	EFM2	YBR271W	1260 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	SRV2	YNL138W	1581 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	SKM1	YOL113W	1968 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	GPI18	YBR004C	1302 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	YDR274C	YDR274C	372 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	SEC72	YLR292C	582 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	NKP2	YLR315W	462 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	ELA1	YNL230C	1140 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	OM14	YBR230C	405 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	ATM1	YMR301C	2073 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	FRE7	YOL152W	1863 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	YCF1	YDR135C	4548 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SHE2	P36068	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.75	□□□□□ -1.81

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