Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN1P35523 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN1P35523 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms