Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFC1P35251 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFC1P35251 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFC1P35251 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFC1P35251 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFC1P35251 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC1P35251 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC1P35251 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC1P35251 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms