Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDXP35241 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDXP35241 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RDXP35241 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDXP35241 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDXP35241 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDXP35241 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDXP35241 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDXP35241 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDXP35241 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDXP35241 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDXP35241 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms