Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC1P35052 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC1P35052 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC1P35052 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC1P35052 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC1P35052 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC1P35052 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC1P35052 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPC1P35052 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPC1P35052 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPC1P35052 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPC1P35052 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPC1P35052 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms