Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC13P31276 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms