Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA11P31270 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms