Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA9P31269 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA9P31269 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms