Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-FP30511 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms