Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIPP30301 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIPP30301 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIPP30301 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIPP30301 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIPP30301 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIPP30301 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIPP30301 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIPP30301 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MIPP30301 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MIPP30301 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIPP30301 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIPP30301 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIPP30301 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms