Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB3P28472 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms