Protein–RNA interactions for Protein: P28370

SMARCA1, Probable global transcription activator SNF2L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA1P28370 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA1P28370 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA1P28370 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA1P28370 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms