Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS1P28331 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFS1P28331 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms