Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK4P28324 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK4P28324 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK4P28324 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK4P28324 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELK4P28324 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELK4P28324 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELK4P28324 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK4P28324 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK4P28324 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELK4P28324 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ELK4P28324 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELK4P28324 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ELK4P28324 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELK4P28324 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELK4P28324 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELK4P28324 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELK4P28324 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELK4P28324 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ELK4P28324 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ELK4P28324 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms