Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CANXP27824 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CANXP27824 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CANXP27824 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CANXP27824 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CANXP27824 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CANXP27824 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CANXP27824 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CANXP27824 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CANXP27824 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CANXP27824 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CANXP27824 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CANXP27824 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CANXP27824 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CANXP27824 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CANXP27824 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CANXP27824 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms