Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD27P26842 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD27P26842 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD27P26842 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD27P26842 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD27P26842 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD27P26842 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD27P26842 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD27P26842 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD27P26842 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms