Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN3P26045 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN3P26045 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms