Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX3P23760 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX3P23760 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX3P23760 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX3P23760 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX3P23760 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX3P23760 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX3P23760 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX3P23760 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX3P23760 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX3P23760 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAX3P23760 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX3P23760 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX3P23760 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms