Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX7P23759 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX7P23759 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX7P23759 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX7P23759 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX7P23759 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAX7P23759 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAX7P23759 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX7P23759 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX7P23759 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms