Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB1P23443 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KB1P23443 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB1P23443 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms