Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPD1P23109 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms