Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHCGRP22888 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHCGRP22888 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms