Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB1P20618 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB1P20618 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms