Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB6AP20340 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms