Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRM3P20309 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM3P20309 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM3P20309 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms