Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMY2BP19961 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMY2BP19961 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms