Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL3P19876 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms