Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCLP18206 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCLP18206 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCLP18206 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCLP18206 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCLP18206 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCLP18206 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCLP18206 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VCLP18206 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCLP18206 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCLP18206 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCLP18206 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCLP18206 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCLP18206 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCLP18206 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms