Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR1P18146 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR1P18146 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR1P18146 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms