Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN1P18031 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms