Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DESP17661 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DESP17661 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DESP17661 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DESP17661 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DESP17661 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DESP17661 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DESP17661 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DESP17661 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DESP17661 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DESP17661 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DESP17661 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DESP17661 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DESP17661 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DESP17661 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DESP17661 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DESP17661 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms