Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA1P17302 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA1P17302 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA1P17302 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA1P17302 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA1P17302 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA1P17302 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA1P17302 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA1P17302 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA1P17302 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA1P17302 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA1P17302 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA1P17302 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA1P17302 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms