Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA2P17301 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms