Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2A2P16615 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A2P16615 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms