Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6AP16499 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6AP16499 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms