Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTLA4P16410 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms